论文查重系统对书籍内容引用的处理效率直接受到系统算法的影响。首先，系统需要能够准确识别书籍内容中的引用部分，进而与已有文献进行比对，这需要系统具备较高的文本识别和比对能力。其次，系统的处理效率还受到服务器性能和数据处理速度的限制。优化方面可考虑提升算法的准确性和优化系统的并发处理能力。

在实际应用中，论文查重系统对书籍内容引用的处理效率不仅仅取决于系统本身的技术水平，还受到书籍内容的复杂性和数据量的影响。对于大量引用的书籍内容，系统需要具备高效的数据处理和比对能力，以保证处理效率。因此，提升系统的算法准确性、优化数据处理流程和提升系统的并发处理能力都是提升处理效率的关键因素。